Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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