Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMC5Q6UXY8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms