Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms