Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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RNF212Q495C1 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF212Q495C1 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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RNF212Q495C1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RNF212Q495C1 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RNF212Q495C1 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RNF212Q495C1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RNF212Q495C1 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RNF212Q495C1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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