Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms