Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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