Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SSX1Q16384 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SSX1Q16384 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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SSX1Q16384 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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SSX1Q16384 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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