Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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LAPTM4AQ15012 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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LAPTM4AQ15012 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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LAPTM4AQ15012 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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