Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL19A1Q14993 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms