Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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