Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1SQ13698 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms