Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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