Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 CCDC144NL-AS1-206ENST00000443508 1216 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AL035658.1-201ENST00000415054 357 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 TXK-203ENST00000507351 1153 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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