Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CALCOCO2Q13137 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CALCOCO2Q13137 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CALCOCO2Q13137 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CALCOCO2Q13137 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CALCOCO2Q13137 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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