Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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