Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TRAF2Q12933 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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