Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 OSBPL7-202ENST00000392507 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms