Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PIGFQ07326 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms