Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms