Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms