Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms