Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms