Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 512.3 ms