Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL39P62891 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RPL39P62891 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL39P62891 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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