Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP46P62068 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP46P62068 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP46P62068 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP46P62068 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP46P62068 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP46P62068 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP46P62068 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP46P62068 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP46P62068 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP46P62068 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP46P62068 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP46P62068 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP46P62068 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP46P62068 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP46P62068 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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USP46P62068 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP46P62068 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP46P62068 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP46P62068 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP46P62068 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP46P62068 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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USP46P62068 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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USP46P62068 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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USP46P62068 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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USP46P62068 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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USP46P62068 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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USP46P62068 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP46P62068 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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