Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms