Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIRAP54198 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIRAP54198 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIRAP54198 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIRAP54198 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIRAP54198 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIRAP54198 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIRAP54198 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIRAP54198 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HIRAP54198 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIRAP54198 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIRAP54198 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms