Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PGGT1BP53609 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PGGT1BP53609 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PGGT1BP53609 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PGGT1BP53609 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PGGT1BP53609 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PGGT1BP53609 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PGGT1BP53609 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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