Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms