Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms