Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNNT2P45379 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNT2P45379 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNT2P45379 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNT2P45379 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNT2P45379 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNT2P45379 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNT2P45379 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNT2P45379 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNT2P45379 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNT2P45379 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNT2P45379 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNT2P45379 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNT2P45379 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNT2P45379 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNT2P45379 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TNNT2P45379 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms