Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCAMP43121 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCAMP43121 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms