Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms