Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms