Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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