Protein–RNA interactions for Protein: P34096

RNASE4, Ribonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASE4P34096 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNASE4P34096 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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