Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms