Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP1P29466 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CASP1P29466 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CASP1P29466 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CASP1P29466 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP1P29466 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms