Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms