Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PLNP26678 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PLNP26678 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PLNP26678 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PLNP26678 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PLNP26678 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PLNP26678 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
PLNP26678 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PLNP26678 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PLNP26678 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PLNP26678 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PLNP26678 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PLNP26678 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PLNP26678 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PLNP26678 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PLNP26678 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PLNP26678 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms