Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTSSP25774 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTSSP25774 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTSSP25774 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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