Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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