Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPREP23469 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPREP23469 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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