Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EPHA1P21709 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EPHA1P21709 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms