Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 304.1 ms