Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VCLP18206 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VCLP18206 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms