Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms