Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ESRRAP11474 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ESRRAP11474 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ESRRAP11474 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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