Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLTBP09497 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLTBP09497 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLTBP09497 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLTBP09497 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLTBP09497 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLTBP09497 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTBP09497 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTBP09497 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLTBP09497 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLTBP09497 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTBP09497 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTBP09497 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLTBP09497 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLTBP09497 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLTBP09497 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTBP09497 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLTBP09497 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTBP09497 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTBP09497 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTBP09497 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTBP09497 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLTBP09497 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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