Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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